首先，要注意坚持每天换水。加湿器的水箱长时间使用，如果不及时清洗的话，水箱的内壁就会滋生各种真菌或细菌，其中一些致病菌就会随着汽雾进入空气，再进入人体的呼吸道和肺脏，进而引起过敏反应、发烧，甚至会导致肺炎，尤其是抵抗力差的儿童和老年人。因此，使用时间超过24小时的剩余水一定要倒掉。由于北方水质较硬，所以建议选购带有滤水功能的加湿器，或是使用纯净水、凉白开水、蒸馏水等进行加湿。因为自来水会产生水垢，容易寄居病菌。
同时，还要注意不要彻夜使用加湿器。一般情况下，在空气湿度为55%时，病菌较难传播，但若空气湿度太高，如超过90%，也会使人体呼吸系统和黏膜产生不适，导致免疫力下降，进而诱发流感、哮喘、支气管炎等疾病。加湿器的使用时间不要太长，一般用几个小时就可以关掉，无需整天开着。应注意根据室内湿度的变化和自身感觉及时调整雾气大小，还要适时开窗通风，最好配置一个湿度表，将室内湿度控制在55%左右。要根据自己对湿度的要求，合理调节喷雾量和恒湿值。
此外，消费者还注意不要离人体太近。加湿器是电子产品，工作中可能会有一些电子辐射，因此最好不要离人体太近，应远离热源、腐蚀物和家具等，避免阳光直射。在摆放方面，加湿机要放置在0.5米至1.5米高的稳定的平面上。